A causa dei lavori di potenziamento infrastrutturale presso la stazione Termini, che dureranno fino al 25 ottobre, due treni della tratta Roma-Isernia subiranno modifiche al percorso. I passeggeri del treno regionale 5111, che parte da Roma alle 6:15, con fermata a Venafro alle 8:05 e arrivo a Isernia alle 8:35, dovranno utilizzare un bus sostitutivo fino a Cassino, dove potranno salire sul treno delle 7:42 per proseguire il viaggio. Anche il treno 5329, che parte da Isernia alle 20:35 con fermata a Venafro alle 20:54 e arrivo previsto a Roma alle 22:55, terminerà la corsa a Cassino alle 21:16, con un servizio di bus che collegherà i passeggeri alla Capitale. I sistemi di vendita dei biglietti sono già aggiornati.

Per quanto riguarda la linea Campobasso-Termoli, come già riferito, resta ancora bloccata dalla frana avvenuta il 7 marzo 2023. Di recente, è stato effettuato un sopralluogo per monitorare il dissesto idrogeologico, un problema che ha avuto inizio nel 2017, quando i binari furono danneggiati per la prima volta. Attualmente, i treni sono ancora fermi e il servizio è garantito solo tramite bus. La linea è inclusa in un progetto di riqualificazione finanziato dal Pnrr, che prevede elettrificazione e potenziamento tecnologico delle stazioni da Venafro a Termoli, con un investimento di 154 milioni di euro e termine dei lavori previsto per il 2026.